定義 質粒(plasmid)是細菌擬核裸露DNA外的遺傳物質,為雙股閉合環(huán)形的DNA,存在于細胞質中,質粒編碼非細菌生命所必須的某些生物學性狀,如性菌毛、細菌素、毒素和耐藥性等。質粒具有可自主復制、傳給子代、也可丟失及在細菌之間轉移等特性,與細菌的遺傳變異有關。
特征
是真核細胞細胞核外或原核生物擬核區(qū)外能夠進行自主復制的遺傳單位,包括真核生物的細胞器(主要指線粒體和葉綠體)中和細菌細胞擬核區(qū)以外的環(huán)狀脫氧核糖核酸(DNA)分子?,F(xiàn)在習慣上用來專指細菌(大腸桿菌)、酵母菌和放線菌等生物中細胞核或擬核中的DNA以外的DNA分子。在基因工程中常被用做基因的載體(Vector)。許多細菌除了擬核中的DNA外,還有大量很小的環(huán)狀DNA分子,這就是(plasmid)(補充:部分為RNA)。上常有抗生素的抗性基因,例如,四環(huán)素抗性基因或卡那霉素抗性基因等。有些稱為附加體(episome),這類能夠整合進真菌的染色體,也能從整合位置上切離下來成為游離于染色體外的DNA分子。在宿主細胞體內外都可復制!
目前,已發(fā)現(xiàn)有的細菌有幾百種,已知的絕大多數(shù)的細菌都是閉合環(huán)狀DNA分子(簡稱cccDNA)。細菌的相對分子質量一般較小,約為細菌染色體的0.5%~3%。根據(jù)相對分子質量的大小,大致上可以把分成大小兩類:較大一類的相對分子質量是40×106以上,較小一類的相對分子質量是10×106以下(少數(shù)的相對分子質量介于兩者之間)。每個細胞中的數(shù)主要決定于本身的復制特性。按照復制性質,可以把分為兩類:一類是嚴緊型,當細胞染色體復制一次時,也復制一次,每個細胞內只有1~2個;另一類是松弛型,當染色體復制停止后仍然能繼續(xù)復制,每一個細胞內一般有20個左右。這些的復制是在寄主細胞的松弛控制之下的,每個細胞中含有10-200份拷貝,如果用一定的藥物處理抑制寄主蛋白質的合成還會使拷貝數(shù)增至幾千份。如較早的pBR322即屬于松弛型,要經過氯霉素處理才能達到更高拷貝數(shù)。一般分子量較大的屬嚴緊型。分子量較小的屬松弛型。的復制有時和它們的宿主細胞有關,某些在大腸桿菌內的復制屬嚴緊型,而在變形桿菌內則屬松弛型。
培養(yǎng)
在基因工程中,常用人工構建的作為載體。人工構建的可以集多種有用的特征于一體,如含多種單一酶切位點、抗生素耐藥性等。常用的人工運載體有pBR322、pSC101。pBR322含有抗四環(huán)素基因(Tcr)和抗氨芐青霉素基因(Apr),并含有5種內切酶的單一切點。如果將DNA片段插入EcoRI切點,不會影響兩個抗生素基因的表達。但是如果將DNA片段插入到Hind III、Bam H I 或 Sal I切點,就會使抗四環(huán)素基因失活。這時,含有DNA插入片段的pBR322將使宿主細菌抗氨芐青霉素,但對四環(huán)素敏感。沒有DNA插入片段的pBR322會使宿主細菌既抗氨芐青霉素又抗四環(huán)素,而沒有pBR322的細菌將對氨芐青霉素和四環(huán)素都敏感。pSC101與pBR322相似,只是沒有抗氨芐青霉素基因和PstI切點。運載體的zui大插入片段約為10 kb(kb表示為千堿基對)。
1973年,科學家將作為基因的載體使用,為基因工程的誕生奠定了基礎。
zui常用的是大腸桿菌的。這種常含有抗生素抗性基因,例如,卡那霉素抗性基因。
pBR322
pBR322DNA分子的長度為4363bp,此載體中有兩個標記基因,一個是氨芐青霉素抗性基因(Apr),另一個是四環(huán)素抗性基因(Tetr)。現(xiàn)在已知pBR322DNA分子共有24種核酸內切限制酶的單一識別位點。其中7種限制酶(從12:00位置按順時針方向)即EcoRV、NheI、BamHI、SphI、SalI、XmaIII和NruI的識別位點位于四環(huán)素抗性基因內部,另
外有2 種限制酶即ClaI和HindIII的識別位點是存在于這個基因的啟動區(qū)內,在這9個限制位點上插入外源DNA都會導致tetr的失活。3種限制酶即ScaI、PvuI和PstI的識別位點位于氨芐青霉素抗性基因內,在這些位點插入外源DNA則會導致ampr基因的失活。由pBR322載體的結構可知其具有如下優(yōu)點:(1)具有較小的分子量。經驗表明,為了避免在DNA的純化過程中發(fā)生鏈的斷裂,克隆載體的分子大小不要超過10Kb。pBR322這種小分子量的特點,不僅易于自身DNA的純化,而且可容納較大的外源DNA片段;(2)具有兩種抗菌素抗性基因可供作轉化子的選擇記號,能指示載體或重組DNA分子是否進入宿主細胞以及外源DNA分子是否插入載體分子形成了重組子。標記基因往往可以賦予宿主細胞一種新的表型,這種轉化細胞可明顯地區(qū)別于非轉化細胞。當我們把一個DNA片段插入到某一個標記基因內時,該基因就失去了相應的功能。當把這種重組DNA分子轉到宿主細胞后,該基因原來賦予的表型也就消失了。要是仍保留了原來表型的轉化細胞,細胞內含有的DNA分子一定不是重組子。很顯然,既要指示外源DNA是否進入了宿主細胞,又要指示載體DNA分子中是否插入了外源DNA片段,那么這種載體必須至少具有兩個標記基因。另外,pBR322載體還具較高的拷貝數(shù),而且經過氯霉素擴增之后,每個細胞中可積累1000~3000個拷貝,這就為重組體DNA的制備提供了極大的方便。
pBR322載體的構建
pBR322載體的構建過程可簡單地概括如下:
1、由于pBR322的親本之一是pMB1,故首先以pMB1為基礎,引入Rldrd19的Tn3易位子,得到13.3kb的pMB3;
2、pMB3的分子量顯然使得它不適合作為載體,所以要通過在EcoRI活性條件下的消化讓它大部分的無用片段失去,留下來的小片段的DNA的黏性末端連接起來后就形成了pMB8(2.6kb);
3、此時,另外一種pSC101在EcoRI活性條件下消化產生了含有tetr抗性的DNA片斷,這個片斷和pMB8整合在一起就形成了pMB9(5.3kb)。此時pMB9為ampstetr表型;
4、pMB9已經初步具備載體的功能,為了讓它更加完善,我們要讓它具備amprtetr性能,即在pMB9上引入pSF2124的Tn3易位子,但Tn3可以來也可以走,為了留住它,我們切去了Tn3中表達轉位酶的基因,形成了pBR313。
此后我們兵分兩路:一路把pBR313的PstI位點除去,使之成為ampstetr表型的pBR318;
5、;另一路把pBR313的EcoRII的位點切除,使之成為amprtets表形的pBR320。
由此我們的到了兩種功能互補的,這樣我們只要將他們雜交就可以得到一種接近的載體了,這就是pBR322 。
pBR322的應用
了解了pBR322的結構和它的構建過程之后,我們來看pBR322在基因工程中的應用。
pBR322作為一種常用的基因克隆載體,在實際應用中有著非常重要的地位,其中一個突出的例子就是應用pBR322 作為克隆載體對水稻的葉綠體光誘導基因psbA 進行結構分析。
將水稻葉綠體的DNA,用EcoRI核酸限制性內切酶消化之后,放入含有溴化乙錠的低熔點(LMP)的1%瓊脂糖凝膠中作電泳分離。從LMP中分離出分子大小為1.8~2.5kb之間的DNA片段,再與同樣經過了EcoRI核酸限制性內切酶切割并用堿性磷酸酶作了脫磷酸處理的pBR322連接。然后,將混合物轉化到大腸桿菌5346菌株,培養(yǎng)在氨芐青霉素選擇平板上,形成Ampr轉化子菌落群體。這樣就構成了由EcoRI核酸限制性內切酶切割的水稻葉綠體DNA基因組庫。用Ampr轉化子菌落與32P放射性標記的玉米psbA DNA 探針作菌落雜交,可以分離出其中的陽性克隆體。從這些陽性克隆體中分離出來的重組體DNA,經過進一步的分析,就能測出水稻葉綠體基因psbA的序列。
利用pBR322作為載體重組人體的抑生長激素也是一個經常提到的應用例子。其過程和水稻葉綠體基因重組大同小異,只是除了在載體上插入抑生長激素基因外,還將含有lac操縱子起始部分的片段(包括啟動子、操縱區(qū)、核糖體結合位點和β-半乳糖苷酶的主要部分)插在抑生長激素基因的旁邊。由于有了lac操縱子的控制,重組基因產生的蛋白質的調節(jié)就變得比較容易了。
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